Bojan Krkic gia nhập La Masia và bắt đầu chơi ở:
- Mùa 1999-2000 Benjamín A
- Mùa 2000-01 Alevín B
- Mùa 2001-02 Alevín A
- Mùa 2002-03 Infantil B
- Mùa 2003-04 Infantil A
- Mùa 2004-05 Cadete B
- Mùa 2005-06 Cadete A, Juvenil B và Juvenil A
- Mùa 2006-07 Juvenil A và FC Barcelona B.